Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q08AU9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q08AU9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q08AU9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms