Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MitfQ08874 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MitfQ08874 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MitfQ08874 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MitfQ08874 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MitfQ08874 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MitfQ08874 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MitfQ08874 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MitfQ08874 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MitfQ08874 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MitfQ08874 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MitfQ08874 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms