Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms