Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgm3Q08189 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms