Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou6f1Q07916 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms