Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ebf1Q07802 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms