Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms