Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cab39Q06138 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cab39Q06138 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms