Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Thbs3Q05895 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms