Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms