Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms