Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a1Q04857 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a1Q04857 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a1Q04857 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a1Q04857 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a1Q04857 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a1Q04857 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a1Q04857 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms