Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top1Q04750 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top1Q04750 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms