Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms