Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgfr4Q03142 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms