Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp11Q02853 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp11Q02853 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms