Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctnnb1Q02248 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnb1Q02248 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms