Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VcpQ01853 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms