Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacna1cQ01815 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms