Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gbp1Q01514 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms