Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms