Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja5Q01231 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gja5Q01231 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms