Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms