Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb2Q00977 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms