Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoa1Q00623 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoa1Q00623 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms