Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F8a1Q00558 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F8a1Q00558 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms