Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb4P99026 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms