Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
rp9P97762 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
rp9P97762 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms