Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms