Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Prop1P97458 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Prop1P97458 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prop1P97458 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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