Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps45P97390 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps45P97390 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps45P97390 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms