Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdh6P97326 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh6P97326 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh6P97326 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh6P97326 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh6P97326 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdh6P97326 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms