Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx1P83917 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx1P83917 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms