Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx1P82976 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx1P82976 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms