Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otx2P80206 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otx2P80206 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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