Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms