Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb1P70662 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb1P70662 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms