Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ErfP70459 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ErfP70459 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ErfP70459 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ErfP70459 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ErfP70459 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ErfP70459 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ErfP70459 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms