Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad54lP70270 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms