Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms