Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms