Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnab1P63143 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms