Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lhx1P63006 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx1P63006 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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