Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd6P61407 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tdrd6P61407 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms