Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smg6P61406 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smg6P61406 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms