Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Siah1aP61092 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Siah1aP61092 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms