Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms