Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms