Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dpf3P58269 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms