Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CartptP56388 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CartptP56388 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CartptP56388 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CartptP56388 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CartptP56388 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CartptP56388 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CartptP56388 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CartptP56388 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CartptP56388 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CartptP56388 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CartptP56388 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CartptP56388 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms